【滋賀県版】システム開発会社おすすめ5社と補助金・契約・費用まで徹底ガイド（2025年最新版）
この記事はこんな方に最適です
・滋賀県（大津・草津・守山・栗東・彦根・長浜・近江八幡・米原など）で、Web／業務システム・アプリ開発の依頼先を探している中小企業の経営者・情報システム担当の方
・製造業・物流・小売・サービス・自治体向けに、現場のDX（デジタル化・省人化）を進めたい方
・IT導入補助金／省力化投資補助金／県・市町の独自補助金を使ってコストを抑えたい方
・発注の流れ（要件定義〜契約〜検収）や見積りの妥当性を確かめたい方
最終更新日：2025年9月3日（滋賀県内の補助金・公募情報と掲載企業情報を確認済み）
1. システム開発とは？（まず押さえたい全体像）
システム開発は、課題の見える化 → 設計 → 実装 → テスト → 運用という工程で、業務フローをソフトウェア（Webや基幹システム、モバイルアプリ、機器連携、クラウド）へと置き換える取り組みです。滋賀県の多くの企業では、製造現場の見える化（IoT・センサー・PLC連携）、在庫・ロット・トレーサビリティ管理、受発注のオンライン化、勤怠・経理・人事のSaaS活用などが中心テーマになっています。県内には、製造業と相性の良い現場DXに強い支援策と開発会社が揃っており、「段階的に始めて成果が出たら広げる」という進め方が相性◎です。（県のDX支援メニューも小規模導入→実装拡大を想定して設計されています。） •
2. 依頼前に必ず決めること（失敗を避ける発注準備）
発注の成否は要件の握りで決まります。次の5点を、社内で合意した上で依頼しましょう。
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ビジネス目標とKPI
例：不良率を6か月で -30% 、在庫回転を +10% 、受注処理時間を -40% 。数字で合意します。 -
対象業務の範囲
どの部署・工程を対象にするか。現場ヒアリングの担当（業務オーナー）を指名します。 -
データの出入り口
既存システム（会計、人事、販売、MES、WMS、EC等）との連携点、マスタ整備の責任分担。 -
スケジュールの必須マイルストーン
繁忙期・棚卸・決算など止められない時期を避け、段階リリースにします。 -
制約条件（セキュリティ／社内ルール）
ゼロトラスト方針、クラウド可否、外部持出し、個人情報・機微情報の取り扱い基準など。
チェックリスト（保存用）
- 目的・KPIは数値で表現したか
- 現場の“困りごと”を業務フロー図に落としたか
- 既存システムのAPI／CSV入出力仕様を確認したか
- 権限・ログ・監査要件を明文化したか
- 本番切替の手順とロールバック（元に戻す策）を用意したか
3. 補助金・助成金（滋賀県・市町・国）最新まとめ
滋賀県は段階的DXを後押しする補助金が充実。県・市町・国を横断して、併用可否とスケジュールを早めに確認しましょう。主な制度は以下です。
3-1. 県（滋賀県産業支援プラザ）のDX補助金
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企業のDX推進補助金
対象：県内中小・主に製造関連。IoT/AI等の導入＋人材育成を一体支援。環境整備（機器・ソフト・クラウド・委託）と人材育成（技術指導・研修）が対象。上限は環境整備100万円・人材育成100万円（各1/2）。人材育成は補助金合計の1/4以上を配分する要件あり。2025年度の募集は終了（6/16締切）。次回に向けて設計段階から準備を。 • -
企業現場へのDX実装展開支援補助金
小規模DXで効果確認済みの取組を、大規模・発展的に社内展開するための枠。上限500万円（1/2、下限250万円）。2025年度は2〜3件採択。現場実装の拡大を狙う中堅・中小に向く。 • -
DX相談サロン／IoT研究会／事例集
県内各地で専門家の助言を受けられる場や、AI・IoTの導入事例集も提供。早期の壁打ちに最適です。 •
3-2. 市町のDX系支援
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大津市：生産性向上推進事業費補助金
DX関連（システム構築・改修・運営、セキュリティ含む）／設備／店舗改修まで幅広く対象。上限300万円（1/2）。募集は2025/7/1〜7/31。※年度により要件・期日が変わるため必ず原典確認を。 • -
大津市：デジタル化セミナー開催事業費補助金
3者以上の中小企業が受講する体験型講習会の開催費を支援。上限30万円（10/10）。商店街・商工会など団体での人材育成に有効。 • -
草津市：DX人材育成支援補助金
市内事業者のDX人材の育成・強化に要する経費を支援。上限30万円（1/2）、プロ人材活用で+10万円の上乗せあり（上限40万円）。2025/7/16〜8/22に2次募集（終了）。 • -
守山市：中小企業等デジタル化促進補助金
ソフト／クラウド／委託／機器に加え人材育成（技術指導・研修）も対象。上限20万円（1/2）。2025/5/1〜2026/1/31（予算枠到達で終了）。EC構築、キャッシュレス、会計SaaS導入など小規模DXに好適。 • -
長浜市：DX実証実験プロジェクト事業補助金（第2期）
長浜市をフィールドにした実証を支援。上限300万円（2/3）。市民サービスの利便性向上・地域課題解決をテーマに官民連携で実行。2025年度は公募・選定公表済み。 •
3-3. 国の代表的な制度（県内企業も利用可）
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IT導入補助金2025（通常枠・複数社連携・インボイス枠・セキュリティ対策推進枠）
ソフト／クラウド（最大2年分）／導入関連・活用支援費が対象。枠により補助率・上限が異なります。複数社連携枠の3次締切は2025/10/31 17:00まで受付中（8/21時点情報）。 • -
中小企業省力化投資補助金（一般型）
オーダーメイド性のある設備・システム投資を支援。最大1億円、ソフト・ハードの組合せも可。第3回公募は2025/8/29締切で受付終了、次回公募時期は事務局サイトで告知。 •
スケジュール設計のコツ
- まず国のIT導入補助金／省力化投資補助金の公募スパンを確認
- 同年度の県・市町枠は予算到達＝早期終了が多いので、概算見積と要件定義の素案を前倒しで用意
- 併用不可に注意（同一内容に他補助金はNGが原則）。設計時点で重複排除を宣言できる体制に
4. 契約の基本（トラブルを未然に防ぐ実務の型）
4-1. 契約形態の選び方
- 請負契約（成果物ベース）：要件が固い・スコープ明確・固定価格で進めたいとき。
- 準委任契約（工数ベース）：要件が流動的・アジャイル開発で段階検証したいとき。
- PoC／実証契約：まず3か月・最小構成でKPI検証→次期本実装で請負化、が王道。
4-2. 契約書に必ず入れる条項（抜粋サンプル）
- 受入基準と検収手順（テスト観点・バグ定義・修正期限・軽微不具合の扱い）
- 変更管理（CCB）：仕様変更の起案→影響分析→見積→承認→反映の手順
- 著作権・ソースコードの扱い：カスタム部分の帰属／リポジトリ納品／第三者ライブラリ一覧
- データ保護・セキュリティ：暗号化、ログ、監査、脆弱性対応SLA、個人情報の委託
- 保守SLA：受付時間、初動時間、回復時間目標、パッチ適用の窓口と責任
- 瑕疵担保／損害賠償：上限・除外事由（間接損害等）・保険加入の有無
条文サンプル（抜粋）
・「甲は、受入試験において重大度A・Bの不具合が未解消のとき検収を留保できる」
・「仕様変更は甲乙合意の変更依頼書に基づき、影響見積を経て実施する」
・「本件成果物のうち甲に特化したカスタムコードは甲に帰属する」
5. 費用感（目安と内訳の見方）
- 要件定義・基本設計：50〜300万円（工数×単価／現場ヒアリング回数で増減）
- Web業務システム（中小規模）：300〜1,500万円（ログイン、権限、マスタ、受発注、在庫・帳票）
- 製造現場のIoT＋ダッシュボード：200〜1,000万円（ゲートウェイ、センサー、PLC連携、可視化）
- モバイルアプリ（業務系）：150〜800万円（iOS/Android、バックエンド含む）
- 保守・運用：月5〜50万円（SLA、アラート監視、軽微改修の範囲で差）
見積書のチェック観点
- 要件定義・設計の工数が適切か（実装費に偏り過ぎていないか）
- テスト（単体・結合・総合・受入） の時間配分があるか
- クラウド費（2年分上限など補助要件） の扱いが正しいか
- 教育・活用支援が含まれるか（IT導入補助金では活用支援が対象化） •
6. 滋賀県のシステム開発会社：おすすめ5社（厳選）
選定基準：滋賀県内拠点、製造・流通・自治体等の実績、公式情報の透明性、支援領域の幅。各社の得意分野が異なるため、課題に合う“複数社”へ同時相談をおすすめします。
PR. 株式会社greeden（大阪市北区）｜日本品質×オフショアの“ハイブリッド”で最適解を実装
- Web・アプリ開発に強み。フルスクラッチ～SES まで柔軟対応し、国内で詳細設計→ベトナムで開発するハイブリッド体制で、高品質とコスト最適化を両立。WebアクセシビリティSaaS「UUU」も自社提供。
- 実績・事例：自治体のプレミアム付商品券 給付金事業 、宿泊予約サイト、サブスク型動画配信メディア、行政の移住定住プロモーション（阪南市） など、B2C〜公共領域まで幅広く支援。
- 個人情報は国内で厳格管理し、オフショア側からはアクセス不可とする運用で安心。
- こんなニーズに：①エンジニア不足の解消（外部リソースの活用ニーズにも通じる体制）②コストを抑えつつ品質担保したい③会員制・決済・予約・配信など“運用が効く”Webサービスを構築したい④Webアクセシビリティ導入をローコストで進めたい。
6-1. キステム株式会社（大津市）
- 強み：官公庁・製造・流通・教育・医療など幅広い領域に対応。ISO9001／ISO27001やPマークを取得し、品質・情報管理に配慮。滋賀本社で地域密着×広域対応のバランスが良い。
- 向いているお客さま：自治体・公共系、製造の基幹や住民系業務、セキュリティ要件が厳格な案件。
- 拠点：大津市浜大津1-4-12（他、東京・大阪・京都・彦根に拠点） •
6-2. 日本ソフト開発株式会社（米原市）
- 強み：50年以上の歴史。官公庁・教育・民間まで全国展開の開発・自社製品提供。米原本社で滋賀・近隣県をカバー。
- 向いているお客さま：公共・教育・大規模案件、自社製品とカスタムを組み合わせた導入を検討する企業。
- 拠点：米原市米原西23（東京・大阪に拠点あり） •
6-3. Auto-IDフロンティア株式会社（栗東市）
- 強み：Web／業務システムに加え、制御・物流自動化の装置開発支援までカバー。自動搬送・在庫・トレーサビリティなど、現場の自動化×ITの橋渡しが得意。
- 向いているお客さま：物流・製造での自動化連携、工場の現場最適化とWebの業務可視化を同時に進めたい企業。
- 拠点：栗東市出庭2035。 •
6-4. 株式会社アルファビジネス（草津市）
- 強み：基幹系（生産管理など）の受託開発に強く、要件定義〜保守まで一気通貫。滋賀から東京・大阪も含め支援。
- 向いているお客さま：製造・流通の基幹刷新／スクラッチ開発、大手SIと連携した中〜大規模案件。
- 拠点：草津市野村2-10-26（ホワイトビル3F）。 •
6-5. 株式会社ギガエージェント（草津市）
- 強み：Webシステム／アプリ／HP制作からプロモーションまで一体支援。飲食向けパッケージなど中小規模の実装力が光る。
- 向いているお客さま：店舗・サービス業の業務可視化／予約・顧客管理、ECや集客施策と連動した改善。
- 拠点：草津市追分南3-15-19（草津営業所あり）。 •
候補の広げ方（補足）
彦根・長浜エリアでのWeb／業務システムは、ナックウェブやナユタ等、地域密着の選択肢も。用途により比較検討を。 •
7. 会社選定ポイント（5分で伝わる見極め軸）
- 業界理解×現場理解：製造・物流・小売など自社業界の要件に通じているか（例：ロット管理・ハザード分析・PCS連携など）。
- 要件定義の進め方：ワークショップ／As-Is/To-Beの見える化が定着しているか（成果物サンプルを見せてもらう）。
- セキュリティと品質保証：ISO27001／Pマークなどの体制、テスト工程の手厚さ。
- 伴走力：補助金の要件に合わせた見積・スケジュールに慣れているか（クラウド費の年度按分、活用支援費の扱い等）。 •
- リファレンス：同規模・同業の導入事例（社名非公開でも可）と、運用1年後の効果を確認。
8. サンプル集（すぐ使える“たたき台”）
8-1. RFP（提案依頼書）のミニ雛形
【目的】在庫回転率10%改善、在庫差異率▲50%
【対象】製造本部/物流部（拠点：草津/長浜）
【範囲】受注→引当→製造→出荷の可視化、棚卸効率化
【要件】
- 権限/ログ：AD連携、操作ログ1年保管
- 連携：会計(SaaS)API、既存WMSのCSV
- 非機能：平日日中500同時、RTO 2h/RPO 15min
【スケジュール】PoC3ヶ月→段階本番（繁忙期除外）
【成果物】要件定義書/基本設計/テスト計画/運用手順
【評価】提案力40/価格30/体制20/セキュリティ10
8-2. 見積り内訳サンプル（抜粋）
要件定義 120h、基本設計 160h、実装 480h、結合/総合 200h、受入支援 80h
活用支援 40h（IT導入補助金の活用支援対象）
クラウド利用料 12ヶ月、監視/バックアップ含む
※活用支援費や クラウド利用料（最大2年） の扱いは補助金枠により異なるため、見積書の区分けを明確に。 •
8-3. 受入基準（例）
重大度A: データ損失/業務停止 → 検収不可
重大度B: 主要機能の障害 → 検収条件付き
重大度C: 代替可能な軽微 → 保守票で継続修正
8-4. 補助金スケジュールの型
M-3：要件定義素案／概算見積／申請方針決定
M-2：申請書ドラフト／見積区分の整備（人材育成/環境整備/活用支援）
M-1：社内決裁→申請→事務局照会対応
M0 ：交付決定→契約→着手（決定前着手の可否は制度次第）
※例：守山市は早期着手の申出制度あり（交付保証ではない）。 •
9. 具体事例のヒント（滋賀らしい“現場DX”のツボ）
- 製造×IoT：成形機・検査装置からのデータ収集→原単位／OEE／不良傾向を可視化→段取り最適化。
- 物流×自動化：ハンディ／バーコードとWMS連携、棚卸の時短と誤出荷削減。栗東発の制御×IT支援は親和性高い。 •
- 小売・飲食：予約・モバイルオーダー・在庫連携で人手不足対策と来店体験を改善。 •
- 公共・教育：長期運用を見据えたセキュリティ／運用体制と可用性の設計が鍵。米原拠点の広域支援力を活かす。 •
10. 掲載：滋賀県おすすめ企業リスト（5社・見比べ早見表）
| 会社名 | 本社エリア | 得意領域 | こんな課題に |
|---|---|---|---|
| キステム | 大津市 | 公共・製造・流通・医療、品質/情報管理 | 公共系やセキュリティ要件が厳格な刷新に |
| 日本ソフト開発 | 米原市 | 公共・教育・民間、製品＋受託 | 全国展開の実績で堅実に進めたい |
| Auto-IDフロンティア | 栗東市 | Web/業務＋制御・物流自動化 | 物流・製造の自動化×ITをまとめたい |
| アルファビジネス | 草津市 | 基幹・生産管理のスクラッチ | 業務にピッタリの基幹再構築 |
| ギガエージェント | 草津市 | Web/アプリ＋集客支援 | 店舗・サービス業のDXを軽快に |
（各社情報：公式ページ・会社概要に基づく。詳細は各社へ直接ご確認ください。） •
11. 依頼〜発注の進め方（7ステップの実践フロー）
- 要件素案づくり（本記事のRFP雛形を活用）
- 3社程度に同時相談（課題整理の壁打ちを依頼）
- 現場見学・データ確認（連携仕様・アカウント方針・セキュリティ）
- プロトタイプ／PoC（3か月以内／KPIで判断）
- 本実装の契約（請負／準委任を適切に組合せ）
- 段階リリース（止められない時期を回避）
- 活用支援と定着化（教育・運用改善・効果測定）
12. よくある質問（滋賀県×DX 編）
Q1. まず小さく始めたい。県の制度は合う？
A. 企業のDX推進補助金は人材育成＋小規模導入の組合せで設計されています。まず小さく試し、効果が出たら実装拡大に進む流れが合致します。 •
Q2. 実証から一気に広げたい
A. DX実装展開支援（上限500万円）は、効果検証済みの施策を大規模に社内展開する企業向け。県の想定に沿っています。 •
Q3. 国の補助金との併用は？
A. 同一内容の二重取りは不可が原則。IT導入補助金や省力化投資補助金の枠・対象経費の切り分けを要件定義時から整理し、重複排除できる設計に。 •
Q4. まず人材育成だけでも対象になる？
A. 草津市や守山市の制度は人材育成や講座受講・専門家指導も対象（上限・補助率は制度による）。 •
13. まとめ（今日から動くための3行）
- KPIと範囲を社内で言語化（RFP雛形を活用）
- 3社へ同時相談→PoCで検証（契約形態は柔軟に）
- 補助金の期日逆算で要件・見積区分を整える（人材育成費を忘れずに）
14. 掲載依頼はこちらから（編集部受付のご案内）
滋賀県のシステム開発会社さまへ
当ページでは、県内事業者の発注比較に資するため、以下の内容が確認できる企業さまの掲載依頼を受け付けています（基本掲載は無料）。
必要情報
- 会社名・所在地（市町）・連絡先・Webサイト
- 提供領域（例：Web業務、基幹、制御、モバイル、クラウド、データ分析）
- 主要実績（業界・規模・成果指標／社名非公開可）
- 品質/情報保護（ISO・Pマーク等）
- 県・市町やIT導入補助金の活用支援可否
- 担当者名（公開可否を明記）
ご送付方法
- 件名：「滋賀県・開発会社掲載依頼」
- 本文：上記の必要情報を明記
- 添付：会社案内PDF（任意）、ロゴ（PNG/SVG）
優先掲載（有料・枠限定） もご用意しています。比較表への拡張掲載、導入事例インタビュー、オンライン相談会共催など、県内の発注者に情報が届きやすい形でご案内します。詳細はお問い合わせください。
出典（主要情報）
- 滋賀県産業支援プラザ：DX支援総覧（DX補助金・相談サロン・IoT研究会・事例集） •
- 企業のDX推進補助金（2025年度）：対象・上限（環境整備100万円、人材育成100万円／各1/2）・人材育成1/4以上など。 •
- 企業現場へのDX実装展開支援補助金（2025年度）：上限500万円（1/2、下限250万円）・採択結果。 •
- 大津市：生産性向上推進事業費補助金（DX関連費も対象、上限300万円・1/2）／デジタル化セミナー補助金（上限30万円・10/10）。 •
- 草津市：DX人材育成支援補助金（2025年度）：上限30万円（1/2）、プロ人材で＋10万円。 •
- 守山市：中小企業等デジタル化促進補助金：上限20万円（1/2）、人材育成も対象。 •
- 長浜市：DX実証実験プロジェクト事業補助金（第2期）：上限300万円（2/3）。 •
- IT導入補助金2025（公式／中小企業庁資料）：枠構成・活用支援・複数社連携枠の最新受付。 •
- 中小企業省力化投資補助金（一般型）：制度概要・公募状況。 •
- 企業情報：キステム／日本ソフト開発／Auto-IDフロンティア／アルファビジネス／ギガエージェントの会社概要・所在地。 •
※補助金は年度・枠・回次で要件が変動します。最新の公募要領・交付要綱で必ずご確認ください。
編集方針・アクセシビリティ
- 本記事は 一次情報（県・市・国・企業公式） を参照し、不確実な情報は除外しました。
- 見出し・表・箇条書きで読み上げ配慮、専門用語は日本語補足を添えました。
- コンテンツのアクセシビリティ評価：理解容易性：高／言語レベル：高校生以上／WCAG 2.1 AA相当の配慮。
執筆者より
滋賀のDXは、現場起点で着実に進みます。小さく始めて効果を出し、補助金を賢く使って段階拡張。どうぞ無理なく、でも軽やかに、一歩目を踏み出してみてくださいね。